Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Atp2b2Q9R0K7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b2Q9R0K7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms