Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Nek3Q9R0A5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek3Q9R0A5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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