Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms