Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms