Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ubxn8Q9QZ49 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn8Q9QZ49 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms