Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt3Q9QZ47 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnnt3Q9QZ47 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms