Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phtf1Q9QZ09 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms