Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcl11aQ9QYE3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcl11aQ9QYE3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms