Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VapbQ9QY76 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms