Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp1Q9QY53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp1Q9QY53 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms