Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nufip1Q9QXX8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nufip1Q9QXX8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms