Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc5Q9QX29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc5Q9QX29 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms