Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mid2Q9QUS6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mid2Q9QUS6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms