Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cul3Q9JLV5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms