Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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