Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd2apQ9JLQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd2apQ9JLQ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms