Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkd2l2Q9JLG4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms