Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upk3aQ9JKX8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms