Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp4Q9JKV5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp4Q9JKV5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms