Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrac1Q9JKP8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms