Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx6Q9JKK1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx6Q9JKK1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stx6Q9JKK1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms