Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms