Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scamp5Q9JKD3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp5Q9JKD3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms