Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pard6bQ9JK83 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pard6bQ9JK83 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms