Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cnga3Q9JJZ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnga3Q9JJZ8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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