Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl3Q9JJR7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms