Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riox1Q9JJF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms