Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Jph3Q9ET77 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Jph3Q9ET77 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms