Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn12Q9ET43 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms