Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a4aQ9ET37 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a4aQ9ET37 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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