Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hapln2Q9ESM3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms