Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ush1cQ9ES64 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ush1cQ9ES64 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms