Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk4Q9ERK0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms