Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clstn2Q9ER65 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clstn2Q9ER65 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms