Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ndst3Q9EQH7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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