Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ropn1lQ9EQ00 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ropn1lQ9EQ00 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms