Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Cpsf1Q9EPU4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpsf1Q9EPU4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf1Q9EPU4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms