Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sil1Q9EPK6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sil1Q9EPK6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms