Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rarres2Q9DD06 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms