Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aph1cQ9DCZ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aph1cQ9DCZ9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms