Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bap18Q9DCT6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bap18Q9DCT6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms