Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap3s1Q9DCR2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap3s1Q9DCR2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms