Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnft1Q9DCN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms