Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc107Q9DCC3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms