Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syde1Q9DBZ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms