Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pop5Q9DB28 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pop5Q9DB28 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms