Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PacrgQ9DAK2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms