Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ift43Q9DA69 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms