Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smco2Q9DA21 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms