Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdzd9Q9D9M4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd9Q9D9M4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms